La bandera negra fue creada por la Organización Femenina Popular a partir de la movilización de mujeres contra la guerra que se realizó en el 2001 en la plaza Bolívar.
En esta movilización participaron más de 50.000 mujeres. La intención era que esta bandera fuera puesta en los buses donde iban las mujeres. Este símbolo complementa el de la bata negra y los han caminado juntos desde entonces.
Luego la organización decidió que la bandera sería también un símbolo para las casas de la mujer.
Estas casas eran espacios humanitarios donde todos los actores armados, legales e ilegales, no podían entrar, no podían pisar, un lugar exclusivo para las y los civiles. Fue tan contundente el símbolo de la bandera y el compromiso de las mujeres de hacerlo respetar que posicionó estos espacios. Las casas de la mujer han permitido salvar muchas vidas, ya que se convirtió en un referente sagrado en el municipio y en la región.